Según el área donde se hace:

• Auditoría Financiera:
  Examina los estados financieros del objeto contable, a fin de emitir un informe técnico y profesional que funde la claridad en las operaciones financieras realizadas por el mismo en un periodo determinado.
• Auditoría Administrativa:
  Revisa y evalúa los métodos y procedimientos del proceso administrativo de un ente económico, a fin de asegurar el cumplimiento de los planes, políticas, leyes y reglamentaciones, además de medir el impacto en la estructura de la organización y su productividad.
• Auditoría Operacional:
  Evalúa la empresa y su gestión, a fin de proponer mejoras para aumentar la eficiencia y eficacia productividad. Se realiza a solicitud de la dirección, pero es llevada a cabo por un auditor externo.
• Auditoría Gubernamental:
  Es una auditoría pública, se lleva a cabo por un ente gubernamental con las competencias de ley para hacerlo, en algunos países el encargado de llevarla es el tribunal de cuentas.
• Auditoría Integral:
  Evalúa toda la información posible y útil para emitir un informe certero y completo acerca del cumplimiento ye desempeño de la organización, incluyendo estructura organizacional, información financiera, procedimientos de control interno, objetivos y acatamiento de leyes.
• Auditoría de Sistemas:
  Es la evaluación exhaustiva mediante actividades, técnicas y procedimientos, con el fin de analizar, verificar y forjar recomendaciones relativas a la planificación, seguridad y eficacia de la asistencia informática dentro de la empresa, en busca del mejoramiento del mismo.
• Contable:
  Es la revisión de la situación económica de la empresa, verifica todas las cuentas bien sean por pagar, por cobrar, gastos y ventas, realizada por un auditor externo.

Por área de especialidad

• Auditoría Fiscal:
  Es el tipo de auditoría encargada de examinar los hechos con carácter tributario, puede ser privada aplicada a empresas, comercios, etc. o gubernamental aplicada a instituciones públicas o a organismos dependientes del estado o gobierno.
• Auditoría Laboral:
  Es el estudio objetivo, fiable e imparcial que evidencia el escenario socio-laboral de una empresa. Teniendo en cuenta la situación y obligaciones de la empresa, riesgos por incumplimiento.
• Auditoría Ambiental:
  Son las auditorias cuyos procesos están orientados hacia la detección de posibles complicaciones medioambientales, que pudieran ocasionar el desarrollo de proyectos, el trabajo de las industrias y otras. Igualmente aprecia posibles oportunidades para la conservación del ambiente, por ejemplo, nuevas formas de energías, ahorro de recursos naturales, mejor aprovechamiento eléctrico, entre otros.
• Para implementar este tipo de auditoria se necesita del apoyo y trabajo conjunto de especialistas en áreas como la economía y medio ambiente.
• Auditoría Médica:
  Es un tipo de auditoria donde se hace una evaluación periódica y crítica, del servicio y calidad de la atención médica recibida por los pacientes en clínicas y hospitales, llevada a cabo mediante la revisión de las historias clínicas y el estudio de las estadísticas hospitalarias.
• Auditoría social:
  Es la auditoria que examina y evalúa el comportamiento ético y moral, en torno a los objetivos de la organización, a fin de presentar un informe que establezca acciones para mejorar sus derivaciones sociales.
• Auditoría a Inventario:
  Esta valuación permite establecer la verificación de los registros de inventarios, según los recuentos físicos, a fin de que se investiguen y aclaren las diferencias que puedan surgir en el mismo.
• Auditoría a Caja:
  Es aquella auditoria que realiza un análisis detallado de las operaciones de caja realizadas con dinero en efectivo y cheques, con la finalidad de contrastar que el dinero recibido ha sido formalmente registrado y que los pagos realizados han sido autorizados apropiadamente.